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O Laboratório de Ecologia de Peixes, carinhosamente conhecido como Labeco Peixes, começou embrionariamente quando a recém-doutora Erica Pellegrini Caramaschi foi convidada pelo prof. Rui Cerqueira a desenvolver sua pesquisa no Laboratório de Vertebrados e a participar de um projeto da FINEP na região de Maricá.
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A professora deixou o Museu Nacional, onde desenvolvia projeto com ictiofauna de riachos costeiros com bolsa PDJ do CNPq e foi contratada como professora Visitante em 1987, lotada no Departamento de Ecologia.
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O projeto no rio Ubatiba, em Maricá, atraiu estagiários. No início de um projeto no rio Paraíba do Sul, em 1989, o grupo estava bastante consistente, com graduandos e mestrandos.
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A quantidade de pessoas e o volume do material coletado sobrecarregou o laboratório de Vertebrados e a mudança, com todas as bombonas de peixes, para uma sala do sub-solo foi um processo natural.
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Quando a Prof. Erica foi contratada como prof. Adjunta, em fevereiro de 1993, após prestar concurso, nasceu formalmente o Laboratório de Ecologia de Peixes.
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Em 2007, foi contratada a segunda docente do Laboratório, Profa. Míriam Pilz Albrecht.
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O Laboratório de Ecologia de Peixes tem linha de pesquisa voltada para populações e comunidades de peixes de água doce incluindo alimentação e reprodução de peixes, ovos e larvas, ecomorfologia, diversidade funcional, avaliação de impactos, isótopos estáveis, etc.
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Sob orientação das docentes, o laboratório foi sede da pesquisa de pós-graduandos do PPGE-UFRJ, PPGCiAC-UFRJ, Museu Nacional (PPGZoo) e PGECOL-UFJF. Até março de 2019 foram defendidas 28 monografias, 50 dissertações e 18 teses.
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O Laboratório contabiliza a publicação de 79 artigos científicos, 3 livros e 24 capítulos de livros.